清政府平定大小和卓叛乱后，在新疆设立伊犁将军所辖地区。

伊犁将军:

1.称伊犁总统等将领。是清朝乾隆皇帝平定准部、回民部后设立的名义上的新疆最高军政长官，属武官。

2.伊犁将军管辖范围东至哈密、巴里坤，西至丛林河、楚河、塔拉斯河流域，北至巴尔喀什湖、额尔齐斯河中上游，南至昆仑山。乾隆二十七年，明瑞被任命为首任伊犁将军，至1912年，智瑞作为最后一任伊犁将军结束。伊犁将军控制参赞塔尔巴哈台，参赞乌鲁木齐，参赞喀什。

3.伊犁将军具有指挥驻军、巡察官员、种田牧畜、组织生产、征收赋税、巡边守土等职能。1884年新疆成立后，伊犁将军只负责伊犁和塔尔巴哈台的防务和军政事务。