主要成分不同:碘的主要成分含有酒精，对人体皮肤有很大的刺激。如果直接涂在伤口上，会有疼痛感。碘伏的主要成分是水，对皮肤的刺激性较小，用于皮肤伤口和黏膜时不会引起强烈反应。

用途不同:碘用于注射前或手术前消毒，也可用于大规模消毒。碘伏比碘应用更广泛，逐渐取代碘。

碘是碘和碘化钾的酒精溶液，碘是碘酒。碘酊的消毒能力和腐蚀能力比碘伏强，所以用碘酊即碘酒后要用酒精脱碘，所以只能用于皮肤小面积的消毒，不能用于粘膜，不能用于大面积的消毒，容易对皮肤造成腐蚀。

碘伏属于于中效的消毒剂，可用于皮肤和黏膜的消毒，但消毒效率不如碘酊强。但由于刺激性较小，在临床上被广泛使用。