地下水的破坏主要有机械下切和化学腐蚀。

1.机械底切

由于岩石空缝隙或裂隙中的地下水流动非常缓慢，其机械作用一般较弱，因此只能用于细淤泥质粘土层松散碎屑的机械掏槽。在地下水的长期作用下，岩石结构逐渐变得松散，孔隙扩大。一些软岩或松散的上层，在地下水的机械侵蚀下，甚至会因孔径扩大而引起蠕变变形或坍塌。在黄土地区，这种地下水侵蚀的现象尤为明显，经常有地下渗漏引起的黄土崩塌空。地下水在洞穴或岩石的大裂隙中流动，动能很大，会对地下岩石造成很大的破坏。

2.化学腐蚀

化学溶解是地下水破坏的主要形式，可以形成各种地下岩溶地貌。一般来说，地下水的溶解主要是含二氧化碳的水对碳酸盐岩的溶解。溶解在地下水中的二氧化碳，约有1%会形成碳酸根离子，其余保持游离状态。碳酸的形成大大提高了地下水的溶解性。如果地下水流经可溶岩，化学溶解作用会更明显。含二氧化碳的地下水溶解石灰岩的化学反应式如下:碳酸钙+二氧化碳+水→碳酸氢钙。