花土沟镇地势西北高东南低，山呈峰叠的阿尔金山雄峙其北，白雪皑皑的阿喀祁漫塔格山高耸其西南，形成山盆相间的地形格局。除北部阿哈提山、西南部阿喀祁漫塔格山海拔高度在3800米