昌吉回族自治州地处天山北麓、准噶尔盆地东南缘，东邻哈密地区，西接石河子市，南与吐鲁番地区、巴音郭楞蒙古自治州毗连，北与塔城、阿勒泰地区接壤，东北与蒙古国交界，是古代举世闻名的"丝绸之路"新北道通往中亚、欧洲诸国的必经之路。
　　昌吉历史悠久，在六、七千年以前的新石器时代，昌吉州境内木垒河一带已有原始人类狩猎。公元3世纪初至6世纪中叶，境内先后为高车、突厥、西突厥铁勒部等部族游牧驻地。公元800年，回鹘在高昌建立回鹘汗国，北庭为陪都，自此这里便成了回族聚居区之一。公元十三世纪初，元朝在今吉木萨尔县别失八里设行尚书省，统天山南北畏兀儿之地，成为新疆及邻近地区的政治、军事、文化中心，首府即今吉木萨尔县北庭故城。
　　昌吉州地处天山北坡经济带的核心区域，抱自治区首府乌鲁木齐市；建有乌拉斯台国家一类季节性口岸和亚中商城国家二类通商口岸；州府昌吉市距乌鲁木齐国际机从东西北三面环场18公里，第二座亚欧大陆桥、312国道、216国道、吐乌大高等级公路、乌奎高速公路和亚欧光缆都从州内通过，是东联内地、西接中亚、欧洲市场的黄金通道。