衙院村位于注溪乡南部，以村内衙院自然村得名。距乡政府所在地0.5公里，境内南面属丘陵地带，北面有龙江河，属河谷盆地。东、西、南、北分别与本乡的哨坪、六部屯、中寨、注溪四个